Do zadań Działu Księgowości należy rejestrowanie zdarzeń finansowych i gospodarczych, a w szczególności:

1. prowadzenie ksiąg rachunkowych Biura Funduszu,
2. dokonywanie rozliczeń finansowych Funduszu w tym podatków i składek na ubezpieczenia społeczne,
3. współpraca z bankami w zakresie obsługi finansowej Funduszu,
4. przygotowywanie materiałów służących do opracowywania projektów planów finansowych Funduszu,
5. finansowanie i rozliczanie kosztów krajowych i zagranicznych podróży służbowych,
6. finansowanie i rozliczanie inwestycji prowadzonych przez Biuro Funduszu,
7. sporządzanie okresowych i rocznych sprawozdań finansowych Funduszu,
8. przyjmowanie sprawozdań finansowych z Oddziałów Funduszu i kontrola prawidłowości ich wykonania,
9. sporządzanie zbiorczych sprawozdań finansowych Oddziałów Funduszu,
10. prowadzenie rachuby płac Biura Funduszu,
11.  obsługa kasowa Biura Funduszu.

W skład Działu Księgowości wchodzą następujące jednostki organizacyjne:

1. Sekcja Obsługi Finansowo-Księgowej Pożyczek
2. Sekcja Obsługi Finansowo-Księgowej Biura Funduszu
3. Sekcja Obsługi Finansowej Funduszu.